Alkalmazása: helyezzen fel a hüvelybe naponta kétszer egy-egy benedvesített kapszulát hét napon át, vagy esténkét egyet 14 napon át. A tünetmentes állapot fenntartása érdekében három egymást követő ciklus első felében, a menses után néhány (4-5) napig helyezzen fel egy-egy kapszulát. Alkalmazásának időtartama alatt ajánlott fehérnemű, illetve tisztasági betét használata, kerülendő a spermicidek, a spermicid hatású óvszerek és pesszáriumok használata. Az antibiotikumok egyidejű alkalmazása rontja a GynOphilus hatásosságát.
A fel nem használt kapszulákat óvni kell a nedvességtől, az üvegcse szorosan visszazárandó. A lejárati időn belül később is felhasználhatóak. A Protexin GynOphilus alkalmazása tetszés szerint ismételhető, esetenként fenntartó adagolás is folytatható. Ugyanakkor fontos a hüvelyflórát károsító hatások elkerülése is. Ezért gondolja át, hogy mitől sérülhetett a hüvelyflóra, nehogy a későbbiekben a Protexin GynOphilus-szal visszatelepített Döderlein baktériumok is károsodjanak.